Tuy nhiên, người ta vẫn chưa có những chương trình thanh lọc ra sao để xác định cá thể tương thích với nội dung chọn giống. Do vậy, một chương trình thanh lọc có tính chất “pre-breeding” phải được xác định. Nó sẽ giúp cho việc phát triển đàn heo transgenic hiệu quả và kinh tế hơn. Chương trình thanh lọc giống 3 bước đối với giống heo nọc transgenic được người ta đề nghị để chọn giống heo thông qua kỹ thuật “lai in-situ bằng đánh dấu huỳnh quang” viết tắt là FISH (fluorescence in situ hybridization). Bước một, đánh giá kiểu hình kết hợp với FISH nhằm xác định các con lợn đực transgenic. Bước hai, các cá thể heo có chất lượng tinh dịch và tinh trùng transgenic tốt được phân lập, thông qua phương pháp xét nghiệm truyền thống tinh dịch và kỹ thuật FISH. Phôi thụ tinhin vitro được chuyển qua giai đoạn ba để thanh lọc tiếp: xác định những cá thể có khả năng sản sinh ra phôi transgenic bằng kỹ thuật FISH. Những giống lợn đực “non-transgenic” không có khả năng sản sinh ra tinh trùng transgenic hoặc phôi transgenic sẽ bị loại. Chỉ có giống lợn đực sản sinh ra con lai transgenic được giữ lại phục vụ cho chọn giống và tăng đàn.
Xem http://link.springer.com/article/10.1007/s11248-014-9801-4/fulltext.html.