Trang chủhất thoát năng suất lúa do stress sinh học như bệnh bạc lá (BB), sâu năn và bệnh đạo ôn cũng như các stress phi sinh học như ngập úng và mặn là những rào cản nghiêm trọng trong nội dung tăng năng suất trên toàn thế giới. Phương pháp quản lý đáng tin cậy nhất và hiệu quả nhất đối với những stress như vậy là tính kháng của cây chủ, thông qua cách tiếp cận thân thiện với môi trường và tính hiệu quả về mặt kinh tế.
Việc ứng dụng chỉ thị phân tử (MAS) đã giúp các nhà chọn giống chồng thành công các gen kháng /QTLs điều khiển tính kháng/tính chống chịu đối với bệnh đạo ôn (Pi2, Pi9), sâu năn (Gm1, Gm4), ngập úng (Sub1), và mặn (Saltol) trong giống lúa vừa được phóng thích tại Ấn Độ CRMAS2621-7-1 từ một giống Lalat được cải tiến; nó đã được chồng vào các gen kháng bệnh bạc lá với 3 gen xa5, xa13, và Xa21 để bổ sung với gen Xa4 đã có trong giống Lalat cải tiến. Phân tích di truyền phân tử cho thấy có biểu hiện đa hình rõ ràng giữa bố mẹ cho gen kháng và giống nhận gen kháng đối với những chỉ thị phân tử xác định liên kết với tính trạng mục tiêu.
Phương pháp hồi giao theo truyền thống được thực hiện đến quần thể con lai BC3F1 và sử dụng chỉ thị phân tử từ thế hệ BC1F1, người ta thực hiện kỹ thuật chọn giống lúa nhờ chỉ thị phân tử theo từng bước để thẩm định và theo dõi việc chuyển vào của những alen mục tiêu.
Các dòng con lai của BC3F1s có những gen mục tiêu nói trên / hoặc QTLs mục tiêu thông qua tái tổ hợp trong các dòng con lai có chứa tất cả 10 gen hay QTL kháng stress. Những cây đồng hợp tử kháng/chống chịu theo những tổ hợp mong muốn khác nhau đã được phục hồi. Các dòng con lai ở thế hệ BC3F3 được định tính căn cứ theo tính trạng nông học và phẩm chất hạt; người ta tiếp tục chọn ra các dòng triển vọng để phát triển ra giống mới. Chọn giống nhờ chỉ thị SSR như vậy đã được thực hiện thành công. Hầu hết các dòng được qui tụ nhiều gen mục tiêu ấycó mức độ tương đồng về hình thái nông học giống với dòng mẹ tái tục, ngay cả về tính trạng phẩm chất hạt.
Ngoài những dòng chồng gen ấy, có hai dòng biểu hiện 10 gen kháng/chống chịu và cho thấy mức độ kháng cao với ít nhất năm đối tượng. Nghiên cứu này cho thấy tiềm năng của MAS trong quy tụ nhiều gen kháng vào trong một dòng cây lúa triển vọng với mức độ hồi phục cao biểu hiện gen kháng của bố mẹ.