Phân tích đậu tương GM bằng Kỹ thuật tái bản đẳng nhiệt (LAMP)

Kỹ thuật tái bản đẳng nhiệt (LAMP – LOOP MEDIATED ISOTHERMAL AMPLIFICATION) là một phương pháp tái bản acid nucleic (DNA hoặc RNA) trong một nhiệt độ duy nhất sử dụng một bộ mồi được thiết kế đặc biệt và một DNA polymerase có khả năng vừa tách mạch đôi vừa tổng hợp. Sản phẩm DNA là cấu trúc gốc vòng do sự lặp lại nhiều lần của gen đích. LAMP là phương pháp có độ đặc hiệu cao, hiệu quả, nhanh chóng và sản phẩm có thể quan sát trực tiếp trong ống phản ứng, do vậy phương pháp LAMP có thể là một phương pháp đặc biệt hữu ích để chẩn đoán bệnh truyền nhiễm nhiễm như virus, vi sinh vật,….

Đối với đậu tương GMO, theo Liu M và cộng sự, 2009 (nguồn: ncbi.nlm.nih.gov) nghiên cứu chỉ ra rằng sử dụng phương pháp LAMP, một hệ thống dò tìm nhạy cảm đặc biệt và nhạy cảm cao đối với đậu tương biến đổi gen (Roundup Ready) được thiết kế.

Trong hệ thống phát hiện này, một bộ bốn mồi đã được thiết kế bằng cách nhắm mục tiêu gen ngoại sinh 35S EPSPS. DNA được khuếch đại và thể hiện các băng trên gel agarose trong vòng 45 phút ở điều kiện đẳng nhiệt ở 65 độ C. Không có điện di gel, LAMP amplcon thấy được trực tiếp trong ống phản ứng bằng cách thêm SYBR Green I (N’,N’-dimethyl-N-[4-[(E)-(3-methyl-1,3-benzothiazol-2-ylidene)methyl]-1-phenylquinolin-1-ium-2-yl]-N-propylpropane-1,3-diamine) để kiểm tra mắt thường. Độ nhạy phát hiện của LAMP cao gấp 10 lần so với phương pháp PCR được thiết lập trong phòng thí nghiệm.

Hơn nữa, phương pháp LAMP nhanh hơn nhiều, chỉ mất 70 phút, so với 300 phút đối với phương pháp PCR để hoàn thành việc phân tích đậu tương GM. So với phương pháp PCR truyền thống, quy trình thực hiện LAMP nhanh hơn và nhạy hơn, không cần máy PCR đặc biệt hoặc thiết bị điện di. Do đó, phương pháp này có thể là một công cụ rất hữu ích cho phát hiện GMO và đặc biệt thuận tiện cho việc sàng lọc nhanh. Do vậy, LAMP thường được sử dụng để tạo các bộ kit chẩn đoán nhanh đang được phổ biến rộng rãi trên thế giới.

Nguồn: ncbi.nlm.nih.gov